Rubyで言うところのocraのようにMATLAB m スクリプトからも実行ファイルを生成することが出来ます。
生成するにはMATLAB CompilerとMATLAB以外にコンパイラが必要です。ぼくの場合はVisual Studio 2019を使っています。
またRubyでやるように標準入力でファイルを喰わせることをMATLABでやるには、単純に関数にすれば良いです。
下の例はpdfファイル(他にもテキストが入っているファイルなら可)を読んで表示するだけのプログラムです。
function readPDFtoShow(pdfFile)
data = extractFileText(pdfFile);
fig = uifigure;
txa = uitextarea(fig, 'Value', data);
txa.Position = [10 10 750 550];
fig.Position = [10 10 800 600];
end
アプリケーション・コンパイラは下のようなアイコンをクリックすると起動します。

最低限の設定は”アプリケーション情報”の”アプリケーション名”とメインファイルでファイルを追加設定することです。

あとはパッケージ化ボタンでコンパイルしてくれます。